Selain itu ada juga side quest lain yang tidak kalah rumitnya seperti halnya mencari senjata terkuat dan juga summon yang ada dalam game Final Fantasy yaitu melawan Boss Optional atau saya sendiri lebih enak memanggilnya Secret Boss karena musuh ini terkadang sulit ditemukan oleh para player dan juga untuk mencarinya kita harus ekstra teliti dalam memainkan game karena lokasi dari Boss ini tersembunyi dan juga sulit dicari.
Hal pertama yang harus diperhatikan untuk mencari secret boss FFIX ini adalah pastikan skill para karakter yang dimainkan cukup kuat dan juga memiliki item penyembuh yang cukup banyak karena tak jarang ada Boss yang memberikan efek status pada karakter. Selain itu pastikan save terlebih dahulu sebelum mencari dan melawan Boss berikut ini, supaya saat tejadi hal yang tidak diinginkan kita tidak mengulangi game ini dari save point yang sangat jauh.
Secret Boss Final Fantasy IX
Tantarian
Selama akan menyelamatkan Dagger di Alexandria, kita bisa menemukan Secret Boss yang petama ia adalah Tantarian. Ia hanya akan muncul di perpustakaan Alexandria di disk ke 3, cari dia di pojok rak buku perpustakaan paling belakang. Untuk yang baru pertama kali melawan boss ini pasti akan mengatakan sulit untuk dikalahkan, karena Boss ini akan selalu menggunakan Paper Storm yang membuat seluruh party player mati. Bagaimana tidak ternyata untuk mengalahkan Boss yang satu ini harus menggunakan sedikit trik agar Tantarian bisa dikalahkan.

Quale
Yang kedua adalah Quale gurunya Quina. Quale merupakan Secret Boss yang akan kita lawan setelah Quina behasil menangkap 99 katak. Selain itu setelah berhasil mengalahkan Quale kita akan mendapatkan senjata terkuat milik Quina yaitu Gastro Fork. Untuk melawan Quale tidak terlalu sulit karena dia akan selalu menyarang menggunakan atribut air, jadi pastikan setiap karakter yang akan melawannya menggunakan equip terbaiknya, dan cobalah menyerang dia dengan senjata element petir dan juga magic serta summon petir untuk mendapat damage yang lebih besar.Hades
Yang ketiga adalah Hades, ia berada di Memoria, setelah menemukan save point disebuah tempat yang terlihat seperti air terjun kita akan masuk ke sebuah ruangan di mana Quina akan berenang mengejar ikan ikan. Di tempat inilah Hades sembunyi, cari disebuah jalan dipojok kanan bebatuan, terus tekan tombol X karena disini kita tidak akan menemukan tanda seru untuk menemukan dia. Cari dengan teliti ditempat ini hingga sebuah pesan muncul, setelah itu kita akan melawan Hades.
Ozma
Yang ke empat dan terakhir adalah Ozma, ia adalah secret boss yang paling sulit dikalahkan dalam game FFIX bahkan lebih sulit dari mengalahkan Trance Kuja dan Necron sang Final Boss dari game FFIX ini, untuk menemukan Ozma kita harus menyelesaikan side quest lainnya yaitu berburu harta karun dengan menggunakan Chocobo.Disini kita akan mencari sebuah item bernama Chocograph di Chocobo Forest dan juga Chocobo Lagoon, item ini menunjukan lokasi harta karun yang ada dalam game FFIX, selain itu item ini juga bisa menaikan kemampuan Chocobo dari berjalan di atas lautan hingga kemampuan terbang. Setelah mendapat kemampuan terbang kita bisa mencari dia di Chocobo Air Garden yaitu tempat terakhir mencari Chocogaph yang tersisa.

Perlu diingat untuk melawan Boss yang satu ini mengandalkan equip ultimate weapon dan juga para summon saja tidak cukup, karena Boss yang satu ini memiliki kecepatan untuk menyerang 2x lebih cepat dari party kita dan selalu menggunakan magic yang memiliki high damage dan juga berstatus pada setiap karakter seperti halnya Curse, Lv 5 Death, Lv 4 Holy, Doomsday, Flare, Star Flare, Meteor, Absord MP dan yang lainnya.